236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1028 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  56.27 
 
 		 285 aa  268  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  56.81 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  53.23 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  49.82 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  49.45 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  46.04 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  50.92 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  46.69 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  45.9 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  40.94 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  43.97 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  43.98 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.87 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 283 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.34 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.47 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  28.24 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  29.37 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.57 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.36 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.06 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  28.2 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 443 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  34.33 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 378 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 360 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  28.78 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.86 
 
 		 381 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  24.22 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.48 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.33 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  27.32 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.43 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  33.1 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  25.3 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.05 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  25.3 
 
 		 368 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.28 
 
 		 384 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 367 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>