More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0348 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 284 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  49.05 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  47.67 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  48.67 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  46.92 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  45 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  47.33 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  44.61 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  47.53 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  45.49 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.06 
 
 		 285 aa  201  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  37.98 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  43.75 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  37.74 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.44 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.6 
 
 		 261 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 257 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  31.06 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  30.11 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.88 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.53 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30.64 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  24.88 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.01 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  30.72 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  26.04 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.4 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.85 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.3 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.3 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  25.82 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  24.79 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.32 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  28.19 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.5 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  27.39 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  26.51 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>