34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0143 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 285 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  36.49 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  37.32 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.66 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.7 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.19 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.39 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.24 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  34.87 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.66 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 413 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>