52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4303 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  53.17 
 
 		 283 aa  272  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  53.52 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  47.25 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  38.75 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 		 285 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.12 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  30.8 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.92 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.2 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.12 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 413 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 413 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 443 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 369 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 430 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.45 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.66 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 427 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 375 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 269 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.05 
 
 		 381 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 241 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>