50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 287 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  42.49 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  37.11 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  35.4 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.64 
 
 		 285 aa  138  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  30.5 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  32.95 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  35.82 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  37.87 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 443 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  27.1 
 
 		 415 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 290 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  29.79 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.01 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.42 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 372 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.85 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  24.07 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  20.77 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  20.99 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  29.17 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 388 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 		 371 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.57 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 358 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>