63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3388 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 283 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  84.45 
 
 		 283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  53.52 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  49.47 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  38.75 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  37.54 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.39 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.38 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  34.47 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  34.81 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  30.65 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 430 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  31.97 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 		 339 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  31.97 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  31.29 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  31.29 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.95 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.3 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.18 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.97 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  26.94 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  24.56 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  24.56 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.77 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  24.56 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5172  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 295 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>