93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3145 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 283 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  47.25 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  49.12 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  48.06 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  37.32 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  37.32 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.93 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.88 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.94 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.48 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.78 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.32 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 413 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 		 341 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 430 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  21.2 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.21 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 363 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 244 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 372 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 375 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  27.33 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  27.33 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  27.33 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  27.33 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  27.95 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.55 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  24.71 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  27.33 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.14 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  25.35 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  24.71 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  21.59 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  23.94 
 
 		 246 aa  42  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 251 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>