More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0671 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 278 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  58.96 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  58.24 
 
 		 281 aa  288  8e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  57.92 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  56.43 
 
 		 279 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  48.48 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  45.49 
 
 		 280 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  48.11 
 
 		 280 aa  238  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  48.26 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  47.25 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  54.37 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  49.62 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  39.92 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  47.53 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.38 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  32.4 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  38.01 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  34.8 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.34 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  36.26 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.63 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  30.94 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.36 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.01 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.41 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.93 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  28.92 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  28.4 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  25.68 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  22.69 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0531  ABC transporter permease  23.94 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  23.11 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  24.85 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.26 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  25 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  19.27 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  22.81 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  23.9 
 
 		 385 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 443 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 413 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 387 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  24.58 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  25 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  29.21 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.64 
 
 		 382 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  21.53 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 259 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>