236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7344 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  100 
 
 
306 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  47.69 
 
 
280 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  49.21 
 
 
280 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  47.64 
 
 
280 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  45.77 
 
 
276 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  44.11 
 
 
285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  45.69 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.53 
 
 
285 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  44.06 
 
 
266 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  44.11 
 
 
281 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  39.92 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  38.83 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 
275 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  37.98 
 
 
284 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.47 
 
 
287 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.46 
 
 
278 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 
283 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
257 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.77 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
265 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  23.72 
 
 
246 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  25 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
259 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
262 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  25 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  27.89 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.39 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  21.76 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  21.76 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.22 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  20.73 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  20.73 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  20.73 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.07 
 
 
360 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  20.73 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  20.21 
 
 
244 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  20.73 
 
 
244 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 
251 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 
375 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  20.73 
 
 
244 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
269 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  30.99 
 
 
255 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  23.75 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 
360 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
244 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 
251 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  28.31 
 
 
244 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.6 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  19.69 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 
254 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  23.08 
 
 
253 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
367 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  23.65 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
241 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  30.05 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.42 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
254 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  26.94 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 
243 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  23.88 
 
 
249 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  23.88 
 
 
249 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  23.88 
 
 
249 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.59 
 
 
265 aa  52.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.43 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
274 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>