74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3163 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 283 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  84.45 
 
 		 283 aa  431  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  53.17 
 
 		 287 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  48.06 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  39.78 
 
 		 278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.77 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.59 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  32.45 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  34.06 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  31.82 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  30.06 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 377 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 430 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 360 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.67 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  31.68 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 388 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 363 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.93 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.61 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.61 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.27 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.23 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  23.83 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.24 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  30.71 
 
 		 374 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  26.87 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  23.83 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.53 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.86 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  29.79 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  29.79 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 250 aa  42  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 273 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>