95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7157 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  100 
 
 		 278 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  38.75 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.52 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  38.44 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  32.95 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  39.22 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.66 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  37.36 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.28 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 413 aa  68.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.73 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.71 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  32.26 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  22.83 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.14 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  30.92 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 372 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 358 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  27.89 
 
 		 372 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  31.16 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  27.49 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  33.12 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  28.65 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 430 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  28.65 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  28.07 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  28.07 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  29.69 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  21.25 
 
 		 348 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.74 
 
 		 365 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  29.44 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  27.91 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  29.23 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  25.45 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.91 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  27.91 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  26.97 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  28.89 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  23.84 
 
 		 428 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  26.58 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>