205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3548 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  100 
 
 		 251 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  53.88 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  39.02 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  41.56 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  42.17 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  34 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  34.27 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  43.6 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  35.1 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.65 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.56 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.42 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  27.4 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.46 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  22.61 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  28.79 
 
 		 377 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 381 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 383 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 383 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 383 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  33.1 
 
 		 378 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.59 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  29.68 
 
 		 380 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 371 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.66 
 
 		 365 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 383 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  28.77 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  24.79 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  30.34 
 
 		 1106 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  26.1 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 370 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  27.89 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  27.89 
 
 		 363 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.74 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.49 
 
 		 384 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  27.89 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  27.89 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  27.89 
 
 		 363 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  27.89 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  27.89 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 		 367 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.16 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  24.2 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 387 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.67 
 
 		 356 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 384 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 378 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  27.4 
 
 		 366 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0531  ABC transporter permease  21.68 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 359 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  28.67 
 
 		 391 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>