19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0531 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0531  ABC transporter permease  100 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  23.92 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 278 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  22.07 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.38 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  22.33 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  21.82 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  21.85 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  21.01 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  21.01 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  21.01 
 
 		 287 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>