197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3151 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  63.97 
 
 
247 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.52 
 
 
232 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  30.61 
 
 
251 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.12 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
278 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
267 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.27 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 
339 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
360 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 
360 aa  78.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.73 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
367 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
371 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 
366 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 
341 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.29 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 
381 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
388 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
353 aa  58.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  28.46 
 
 
366 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 
356 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 
254 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  26.87 
 
 
366 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 
369 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.86 
 
 
381 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  25 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 
373 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.69 
 
 
365 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 
378 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  25.19 
 
 
375 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 
378 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 
375 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
363 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 
382 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 
253 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
372 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
285 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  26.28 
 
 
385 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 
370 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  22.47 
 
 
373 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  29.77 
 
 
372 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.58 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  28.12 
 
 
381 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 
388 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  29.2 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
368 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 
384 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  33.02 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.46 
 
 
382 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 
387 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.43 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  26.15 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
376 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 
373 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 
373 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 
373 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 
373 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  30.17 
 
 
373 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
376 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 
367 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  27.08 
 
 
381 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  27.08 
 
 
381 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  26.72 
 
 
379 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  27.08 
 
 
381 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 
378 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 
376 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 
376 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  27.08 
 
 
380 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  27.08 
 
 
380 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>