More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3695 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  56.97 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  56.57 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  51.41 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  39.09 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  35.5 
 
 		 366 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.05 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.85 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.05 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.9 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.77 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.31 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.51 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.22 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  30.83 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.67 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.23 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.29 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  33.1 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.61 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  24.9 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.05 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.45 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.14 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.51 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.7 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  28 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  30.58 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  30.18 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  26.96 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30.45 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.15 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  29.79 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.94 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>