194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0481 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  100 
 
 
267 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  43.96 
 
 
278 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  45.15 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 
246 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  36.55 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  36.8 
 
 
244 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  37.75 
 
 
231 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  37.9 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.75 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  33.53 
 
 
375 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
360 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 
443 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 
366 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.88 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26 
 
 
336 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.2 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  26.81 
 
 
377 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  23.3 
 
 
369 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.5 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 
358 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  32.16 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 
263 aa  52  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  26.07 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  26.58 
 
 
381 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.05 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 
356 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  28.95 
 
 
373 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  25 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  25 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  25.48 
 
 
381 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
280 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5478  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
413 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  25 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  25 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 
372 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 
381 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
361 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 
244 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 
258 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
373 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.93 
 
 
376 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
361 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
373 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 
373 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  25 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  28.16 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  25.48 
 
 
381 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  28.99 
 
 
371 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.11 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 
365 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 
371 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 
257 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
373 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  24.05 
 
 
381 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 
367 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>