198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0093 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 356 aa  696    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 325 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 		 327 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 375 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25.08 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  25.2 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.64 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.34 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25.36 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  28.07 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  24.15 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  24.43 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  24.18 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  28.9 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  24.66 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  24.66 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  27.13 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  21.83 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.6 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.08 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  24.65 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  20.42 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  24.72 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  20.06 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  24.72 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  19.88 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.7 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  26.44 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20.72 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  19.76 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  22.5 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  22.03 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  27.15 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  24.13 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  20.84 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  21.63 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  20.98 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  21.51 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  21.98 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.02 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  20.63 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.25 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  20.4 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 233 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.47 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  19.88 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 256 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  20.12 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  24.88 
 
 		 256 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 359 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 443 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  29.5 
 
 		 251 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>