More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2681 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 285 aa  558  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  69.73 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  66.32 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  61.59 
 
 		 281 aa  320  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  58.3 
 
 		 278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  51.93 
 
 		 280 aa  275  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  52.98 
 
 		 280 aa  275  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  52.55 
 
 		 272 aa  254  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  44.17 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  46.01 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  56.86 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  44.11 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  44.32 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  43.66 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.05 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.75 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  34.42 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.02 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 413 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25.43 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  25.45 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.82 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  32.82 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24.89 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.22 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  28.48 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  31.67 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  22.41 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  25.55 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  29.48 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  28.77 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25.74 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.21 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  23.18 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  22.79 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.14 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  24.32 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 371 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.51 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  26.45 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  26.45 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.89 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>