80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1906 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 250 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  37.56 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  37.56 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  37.56 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  37.09 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  37.56 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  37.09 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  37.09 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  41.01 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  35.74 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  27.4 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  25 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  30.93 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.78 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  22.86 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  26.46 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  31.65 
 
 		 379 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.5 
 
 		 376 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 366 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.99 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 348 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.69 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.98 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.63 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  29.12 
 
 		 366 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  32.21 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.97 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  23.74 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 387 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  27.14 
 
 		 385 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 380 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>