26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4668 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 146 aa  272  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  49.62 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  37.62 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  39.39 
 
 		 244 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.33 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 271 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  36.84 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  38.16 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 244 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 250 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 243 aa  43.5  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 243 aa  43.5  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  36.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  36.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  36.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  36.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  36.54 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  44 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  36.67 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 241 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>