71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0256 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 258 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  42.02 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  36.57 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  29.88 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  29.46 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  29.46 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  29.88 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  29.39 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  25.5 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  22 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  22 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  31.84 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.83 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.44 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 388 aa  48.9  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.89 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 341 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.72 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.54 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.89 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.64 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.12 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.57 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.56 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  25.43 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.28 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  31.36 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.5 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 381 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 281 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 285 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 270 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.36 
 
 		 253 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>