35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4202 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  54.32 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  44.94 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  46.34 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  47.77 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  27.54 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2296  hypothetical protein  35.21 
 
 		 103 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  22.8 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  23.2 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  23.2 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  22.8 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  22.8 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  20.88 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  22.8 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  22.8 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  22 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  21.05 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.54 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  20.65 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.14 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  24.48 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>