46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 258 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  61.75 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  58.53 
 
 		 271 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  46.34 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  42.28 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  25.82 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  25.41 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  25.41 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  25.82 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  25.82 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  26.34 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.36 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.36 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.72 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  19.92 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  19.92 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  28.76 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  26.56 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.44 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  27.67 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 360 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>