47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0193 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  34.16 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  32.04 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  30.26 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  30.26 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  30.26 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  30.26 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  30.36 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.4 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.24 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  24.26 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1654  ABC transporter, permease component  26.83 
 
 		 169 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.29 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 413 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.9 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  22.22 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  26.72 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>