17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1654 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1654  ABC transporter, permease component  100 
 
 		 169 aa  329  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  44.71 
 
 		 242 aa  144  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  24.86 
 
 		 365 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  24.29 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 339 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 360 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.07 
 
 		 261 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 		 327 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  30.09 
 
 		 721 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5081  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0143169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 360 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 369 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5404  putative ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 		 234 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 269 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  29.2 
 
 		 721 aa  40.8  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>