79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5081 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5081  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0143169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5404  putative ABC transporter, permease protein  93.59 
 
 		 234 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4965  ABC transporter, permease  80.34 
 
 		 234 aa  374  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000124148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  79.91 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  79.91 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  79.91 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  79.49 
 
 		 234 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5459  putative ABC transporter, permease protein  79.06 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00659493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5408  ABC transporter, permease protein, putative  50.21 
 
 		 235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.298823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  46.38 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5546  ABC-2 type transporter  45.96 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000580029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  23.24 
 
 		 943 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  25.27 
 
 		 921 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  27.62 
 
 		 357 aa  52.8  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  28.69 
 
 		 927 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  23.12 
 
 		 916 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3597  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 367 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 372 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  24.85 
 
 		 994 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  23.73 
 
 		 922 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 375 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 371 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  23.53 
 
 		 920 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  24.31 
 
 		 930 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  24.38 
 
 		 915 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.95 
 
 		 365 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  29.46 
 
 		 1071 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  29.46 
 
 		 1079 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  29.46 
 
 		 1071 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  29.46 
 
 		 1089 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  28 
 
 		 925 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  29.46 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 369 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  21.72 
 
 		 916 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  29.46 
 
 		 1082 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.46 
 
 		 1066 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  26.52 
 
 		 901 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.26 
 
 		 914 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  22.42 
 
 		 917 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 		 919 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  27.05 
 
 		 914 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.29 
 
 		 384 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  21.28 
 
 		 922 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.23 
 
 		 906 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  26.23 
 
 		 906 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  23.81 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  29.31 
 
 		 936 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  29.31 
 
 		 936 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  24.31 
 
 		 911 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  26.23 
 
 		 906 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  26.8 
 
 		 376 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  21.72 
 
 		 916 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  25.6 
 
 		 933 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  28.65 
 
 		 366 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  22.99 
 
 		 911 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  26.92 
 
 		 365 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1654  ABC transporter, permease component  24.71 
 
 		 169 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  24.88 
 
 		 942 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 373 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 370 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 365 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 371 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 375 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  27.51 
 
 		 366 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  24.71 
 
 		 374 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 370 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 371 aa  41.6  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  26.06 
 
 		 929 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  26.72 
 
 		 370 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>