34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5408 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5408  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
235 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.298823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5081  ABC-2 type transporter  50.21 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0143169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4965  ABC transporter, permease  50.21 
 
 
234 aa  235  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000124148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  50.21 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5404  putative ABC transporter, permease protein  48.94 
 
 
234 aa  234  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  50.21 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5459  putative ABC transporter, permease protein  49.79 
 
 
234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  50.21 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  50.21 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5546  ABC-2 type transporter  46.81 
 
 
235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000580029  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  42.98 
 
 
235 aa  194  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3597  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  26.43 
 
 
942 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  28.69 
 
 
376 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  29.92 
 
 
369 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 
372 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1662  ABC transporter permease  29.92 
 
 
369 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1842  ABC transporter, permease protein  29.92 
 
 
346 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.737626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1794  ABC transporter permease  29.92 
 
 
369 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  26.01 
 
 
357 aa  45.8  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  29.92 
 
 
369 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 
366 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  20.76 
 
 
379 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 
368 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 
391 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  25 
 
 
943 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4642  hypothetical protein  31.13 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 
372 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  24.39 
 
 
387 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4656  hypothetical protein  31.53 
 
 
231 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4657  hypothetical protein  31.53 
 
 
231 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
373 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>