41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_5525 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  99.15 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4965  ABC transporter, permease  98.72 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000124148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  98.72 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5459  putative ABC transporter, permease protein  97.44 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00659493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5404  putative ABC transporter, permease protein  81.2 
 
 		 234 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5081  ABC-2 type transporter  79.91 
 
 		 234 aa  371  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0143169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5408  ABC transporter, permease protein, putative  50.21 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.298823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  46.81 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5546  ABC-2 type transporter  46.81 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000580029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 372 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  22.95 
 
 		 280 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  22.92 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3597  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.5 
 
 		 347 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  23.44 
 
 		 943 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  21.37 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  24.74 
 
 		 916 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  28.12 
 
 		 927 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 358 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.75 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  22.7 
 
 		 936 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  22.7 
 
 		 936 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.56 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  21.74 
 
 		 922 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  19.26 
 
 		 917 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  22.61 
 
 		 921 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  25.68 
 
 		 906 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.68 
 
 		 906 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  25.68 
 
 		 906 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 		 1079 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  26.96 
 
 		 1089 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  27.11 
 
 		 365 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 		 1071 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 		 1071 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  26.96 
 
 		 1066 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.96 
 
 		 1082 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>