72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4352 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4618  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0420  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0643104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  32.03 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  32.37 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  29.85 
 
 		 482 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  34.65 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  28.8 
 
 		 760 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.99 
 
 		 397 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  30.97 
 
 		 483 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.59 
 
 		 365 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  30.95 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  30.97 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  39.44 
 
 		 901 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  46.94 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  39.44 
 
 		 901 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  33.02 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  29.2 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5081  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0143169  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.51 
 
 		 379 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.41 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  30.16 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  32.43 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  33.02 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  30.16 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 378 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  50 
 
 		 369 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  28.1 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  30.16 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4965  ABC transporter, permease  30.16 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000124148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  34.65 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 		 368 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  31.11 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.69 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  52.78 
 
 		 369 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 373 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  30.65 
 
 		 377 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  42 
 
 		 368 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  42.19 
 
 		 373 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  42.19 
 
 		 373 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  42.19 
 
 		 373 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  54.05 
 
 		 371 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  52.27 
 
 		 380 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  60.61 
 
 		 435 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  40.35 
 
 		 368 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 366 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  40.35 
 
 		 368 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 		 242 aa  42  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 373 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  30.38 
 
 		 379 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 373 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 371 aa  42  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 373 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 373 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>