12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4618 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4618  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 262 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0420  ABC-2 type transporter  83.21 
 
 		 262 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0643104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  33.04 
 
 		 482 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  28.65 
 
 		 760 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  34.21 
 
 		 483 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  32.24 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  27.21 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>