18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1668 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  91.1 
 
 		 482 aa  816    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  936    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  42.22 
 
 		 760 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  41.75 
 
 		 754 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  33.33 
 
 		 278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 278 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  33.33 
 
 		 278 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  24.32 
 
 		 197 aa  47  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  27.23 
 
 		 337 aa  46.6  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  40.74 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.98 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4618  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 262 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0420  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 262 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0643104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  32.95 
 
 		 215 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>