18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1285 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1668  hypothetical protein  91.1 
 
 		 483 aa  770    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00126886  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  937    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  41.6 
 
 		 760 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  40.62 
 
 		 754 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  27.03 
 
 		 197 aa  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  31.78 
 
 		 278 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 		 278 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 		 278 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  31.78 
 
 		 278 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  31.78 
 
 		 278 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4618  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 262 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.21 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  27.89 
 
 		 337 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  25.51 
 
 		 160 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0420  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 262 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0643104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  27.23 
 
 		 257 aa  43.5  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 		 243 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>