138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2063 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  100 
 
 
278 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  99.28 
 
 
278 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  99.64 
 
 
278 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  99.28 
 
 
278 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  94.24 
 
 
278 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  65.17 
 
 
275 aa  328  7e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  63.94 
 
 
271 aa  316  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  67.16 
 
 
271 aa  311  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  62.03 
 
 
274 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  55.64 
 
 
273 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  62.41 
 
 
271 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  62.41 
 
 
271 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  61.57 
 
 
274 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  61.57 
 
 
274 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  63.53 
 
 
271 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  48.47 
 
 
276 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  48.52 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  43.82 
 
 
272 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  38.91 
 
 
272 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  50 
 
 
276 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  41.35 
 
 
272 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  41.24 
 
 
275 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  41.76 
 
 
275 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  42.39 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  40.82 
 
 
276 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  43.59 
 
 
276 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  39.93 
 
 
275 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  45.34 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  45.34 
 
 
276 aa  155  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  49.78 
 
 
275 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  50.22 
 
 
275 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  39.11 
 
 
278 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  42.98 
 
 
274 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  34.53 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  44.08 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
292 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
283 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
295 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  41.26 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
295 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
295 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  30.72 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 
291 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 
279 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  38 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
279 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
281 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
286 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 
291 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 
283 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
282 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.65 
 
 
332 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
298 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  30.74 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  32.74 
 
 
298 aa  89  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 
276 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  39.55 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  35.14 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  29.01 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.67 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  41.32 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  29.61 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  30.14 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  26.1 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.95 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  26.55 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  25.11 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.26 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  24.53 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  23.83 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  34.09 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.34 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  27.4 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  28.19 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  38.39 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  33.54 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  32.23 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  30.41 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  31.21 
 
 
318 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  24.14 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  21.91 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  24.18 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.25 
 
 
328 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.08 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1773  hypothetical protein  38.46 
 
 
546 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  25.64 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  28.87 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  23.62 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  26.72 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>