175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1479 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  510  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  72.22 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  75.19 
 
 		 271 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  70.37 
 
 		 271 aa  357  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  79.34 
 
 		 271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  79.34 
 
 		 271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  68.89 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  74.44 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  73.7 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  73.7 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  63.53 
 
 		 278 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  63.16 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  63.16 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  63.16 
 
 		 278 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  63.53 
 
 		 278 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  45.83 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  45.02 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  45.99 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  39.78 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  38.87 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  39.85 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  46.9 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  48.8 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  39.42 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  38.6 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  40.59 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  51.11 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  50.22 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  40.88 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  44.84 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  38.52 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  43.11 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  43.11 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  34.07 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  33.92 
 
 		 283 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  29.9 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  35.32 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  29.28 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.31 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.56 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.87 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  31.6 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  27.72 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  28.2 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  36.1 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  46.51 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  27.02 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  46.34 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  28.26 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  30.28 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  45.69 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  31.54 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  24.43 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  25.38 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.81 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  23.51 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.98 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  25.68 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  26.39 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  31.54 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  34.29 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  30.69 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  31.96 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.62 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  27.59 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.71 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  30.69 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.79 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  30.43 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.05 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  25.73 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>