113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2643 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 276 aa  532  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  31.82 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  33.22 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  32.98 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  37.57 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  31.31 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  37.3 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  36.46 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  30.97 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  30.85 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  34.05 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  31.35 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  46.15 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  27.4 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  31.38 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  33.33 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  28.19 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  29.79 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.1 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.95 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  31.72 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  41.94 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  32.79 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.13 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  31.58 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  31.58 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  38.83 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  33.86 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  24.14 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  26.7 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  31.25 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  30 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  27.87 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.55 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  34.81 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  30.69 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  30.69 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  35.25 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  26.37 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  28.64 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.06 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 623 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  28.27 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  35.38 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  33.69 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  33.16 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  25.95 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  42.67 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  25.63 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.36 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  32.54 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  27.23 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  30.51 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  52.38 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  36.7 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.83 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.91 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  29.45 
 
 		 465 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.85 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  29.07 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  43.08 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  46 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  29.45 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  32.03 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.06 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  37.7 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  24.62 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  27.83 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>