113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3145 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  100 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  92.73 
 
 		 275 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  72.36 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  69.57 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  70.29 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  64.13 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  65.22 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  65.22 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  43.84 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  44.04 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 		 272 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  38.04 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  41.3 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  40.57 
 
 		 275 aa  188  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  46.51 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  41.09 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  48.36 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  41.52 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  48.36 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  42.39 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  41.76 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  44.74 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  42.12 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  41.39 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  42.14 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  41.03 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  46.52 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  41.39 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  40.07 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  40.07 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  39.48 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  39.48 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  40.36 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 283 aa  131  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  37 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  33.33 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  24.24 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  23.48 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  33.33 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  33.19 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.32 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  27.56 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  27.61 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  29.82 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.57 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.13 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  37.61 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  32.03 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  32.32 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  27.22 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  27.19 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  27.42 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.26 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  35 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  34.17 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  29.33 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  23.79 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.69 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  31.03 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  23.62 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  23.39 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  30.89 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  27.34 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  46.03 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  29.81 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  25.63 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  30.26 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  30.87 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  31.03 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  29.82 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2679  copper ABC transporter permease  33.33 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  37.78 
 
 		 391 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  30.5 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>