75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0228 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  100 
 
 
274 aa  525  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  38.21 
 
 
269 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 
319 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  31.8 
 
 
299 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 
278 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 
283 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.97 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  32.99 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  27.74 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  32.88 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  29.07 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 
276 aa  82  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  33.33 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  30.32 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  29.29 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  33.66 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  28.76 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  31.05 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  28.18 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  37.7 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  37.7 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.29 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  33.97 
 
 
275 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  30.04 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  30.04 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  37.7 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  26.95 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.13 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  31.71 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  30.73 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 
623 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  30.63 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  34.55 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  28.81 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  34.43 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  30.23 
 
 
304 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  37.59 
 
 
276 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  27.27 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  30 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  33.13 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  29.97 
 
 
272 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
274 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  26.15 
 
 
272 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  33.58 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3609  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.69 
 
 
478 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000164741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  29.52 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  27.94 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  32.84 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.91 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  29.25 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.57 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  31.33 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 
272 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.27 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  27.37 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  28.1 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  34.05 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  33.51 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.75 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>