27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1524 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  100 
 
 
623 aa  1222    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  31.12 
 
 
299 aa  97.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  32.9 
 
 
298 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 
319 aa  88.6  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  31 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  26.91 
 
 
279 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  26.62 
 
 
265 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  27.66 
 
 
278 aa  62  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  24.58 
 
 
283 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
274 aa  60.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
322 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
283 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.38 
 
 
337 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
290 aa  54.3  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  21.63 
 
 
277 aa  53.5  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 
273 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  27.54 
 
 
295 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  34.04 
 
 
274 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  26.52 
 
 
269 aa  50.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  24.89 
 
 
298 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  36.63 
 
 
273 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.7 
 
 
307 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  22.15 
 
 
278 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1837  hypothetical protein  30.7 
 
 
277 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>