73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0891 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  100 
 
 
278 aa  547  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  40.29 
 
 
273 aa  185  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  36.17 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  34.3 
 
 
299 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  33.67 
 
 
298 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  33.92 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  33.78 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
276 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 
283 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 
322 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  31.93 
 
 
280 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  29.56 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  29.97 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  29.25 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  25.7 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  29.14 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  26.07 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  25.98 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  25.17 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.66 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  31.22 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  30.5 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.42 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  26.97 
 
 
300 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  25.14 
 
 
272 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  24.01 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  28.1 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 
623 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  24.01 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  27.92 
 
 
278 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  27.49 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
272 aa  48.9  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.86 
 
 
337 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  27.49 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  29.47 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  29.11 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  30 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  27.17 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  30.08 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  39.33 
 
 
394 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  35.38 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  28 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  47.92 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  47.92 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  38.66 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  29.81 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  25.29 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  42.31 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  28.45 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.95 
 
 
332 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  28.57 
 
 
901 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 
295 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>