104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2216 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  100 
 
 		 272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  77.57 
 
 		 272 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  72.43 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  70.59 
 
 		 272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  52.54 
 
 		 276 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  51.45 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  47.27 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  53.91 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  53.91 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  40.89 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  42.7 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  40.66 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  45.13 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  43.8 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  43.26 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  41.16 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  43.8 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  41.3 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  42.96 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  41.49 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  41.73 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  41.89 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  43.61 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  42.65 
 
 		 276 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  39.02 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  43.49 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  43.49 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  40.81 
 
 		 271 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  42.26 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  46.52 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 		 295 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  42.35 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  45.56 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  42.35 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  42.86 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  40.53 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  43.53 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  39.91 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  29.71 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.57 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  34.18 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  31.43 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  23.21 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.92 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  38.52 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  36.51 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  22.51 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  25.38 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  30.85 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.81 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  26.37 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  26.2 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  31.15 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  35.85 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  25.56 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.85 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  26.87 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  28.99 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  25.87 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  31.86 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.27 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  32.69 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  25.6 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  28 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  23.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  24.47 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  40.79 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  29.15 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.71 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1274  hypothetical protein  23.83 
 
 		 485 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.82 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  21.64 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  33.01 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>