59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1307 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 
275 aa  530  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  53.82 
 
 
275 aa  306  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  53.82 
 
 
275 aa  296  3e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  49.64 
 
 
275 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  56.69 
 
 
254 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  25.46 
 
 
280 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  22.79 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  24.58 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  24.38 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  25.42 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  24.67 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  22.89 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  25.56 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  25 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  25.19 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  25.19 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  25.19 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  23.01 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  24.66 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  26.44 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  23.3 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  25.96 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  25.53 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  25.48 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  26.87 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  24.21 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  22.81 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  22.88 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  20.18 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  22.42 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  21.56 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  23.58 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 
295 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  21.76 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 
271 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  22.67 
 
 
270 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 
271 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  19.11 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.23 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  24.67 
 
 
299 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  24.79 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  24.79 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  24.2 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  23.33 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  20.94 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  24.81 
 
 
265 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>