37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1215 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  57.78 
 
 
270 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  28.29 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  29.76 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  29.82 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  27.54 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  28.57 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  30 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  29.44 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 
272 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  26.11 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  27.11 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  26.11 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  29.29 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  28.26 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.09 
 
 
276 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  31.15 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  28.14 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  25 
 
 
298 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  23.99 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  25.96 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  26.82 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  22.68 
 
 
275 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.67 
 
 
275 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  27.47 
 
 
271 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  25.85 
 
 
276 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 
280 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  30.86 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.14 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.37 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>