121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1077 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  100 
 
 
275 aa  521  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  62.77 
 
 
276 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  52.71 
 
 
276 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  48.73 
 
 
272 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  50.18 
 
 
272 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  51.45 
 
 
272 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  60.34 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  59.91 
 
 
275 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 
271 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  51.28 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  46.07 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  48.52 
 
 
278 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  48.52 
 
 
278 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  48.52 
 
 
278 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  48.52 
 
 
278 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  42.91 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  39.34 
 
 
274 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  42.91 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  48.52 
 
 
278 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  41.82 
 
 
292 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  42.44 
 
 
273 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  44.12 
 
 
271 aa  188  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  45.29 
 
 
276 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  41.82 
 
 
275 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  41.09 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  44.2 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 
271 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  46.69 
 
 
271 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  44.19 
 
 
274 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
276 aa  174  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  48.46 
 
 
276 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  48.46 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  45.02 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  42.8 
 
 
274 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  42.8 
 
 
274 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  38.13 
 
 
279 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 
281 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
283 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 
291 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  43.26 
 
 
273 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 
286 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  40.17 
 
 
274 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 
291 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 
279 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 
282 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 
295 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  40.35 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  35.14 
 
 
278 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 
283 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  31.75 
 
 
332 aa  85.5  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.78 
 
 
298 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.3 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  23.89 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  32.47 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  21.54 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  27.15 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  27.04 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  28.42 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  37.3 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  34.17 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  36.51 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  27.75 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  24.07 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  25.84 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.67 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  23.91 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  27.17 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  35.4 
 
 
286 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  35.85 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.93 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  27.57 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  28.25 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.14 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.35 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.18 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.54 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.73 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  26.01 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  39.29 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  24.51 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 
244 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  28.95 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  34.92 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  32.35 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.61 
 
 
334 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  33.07 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  36.7 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>