94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4072 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  100 
 
 
265 aa  518  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  33.46 
 
 
269 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 
322 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 
276 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  31.29 
 
 
279 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
298 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.15 
 
 
298 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
290 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
274 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  29.97 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  28.14 
 
 
299 aa  85.5  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  24.91 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  33.45 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.68 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  29.03 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  35.76 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  27.93 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  35.15 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.91 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  34.56 
 
 
281 aa  62.4  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
623 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  27.24 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.14 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  30.1 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  24.73 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  34.67 
 
 
332 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  30.7 
 
 
272 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  26.84 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  37.86 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  27.32 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  36.89 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  37.86 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  31.61 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  31.61 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  33.08 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  40.51 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  25.13 
 
 
298 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  30.16 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  50 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  28.17 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  50 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  46.43 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 
281 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  46.43 
 
 
276 aa  52.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  44.64 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  28.91 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  46.43 
 
 
276 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  34.17 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  30.06 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  26.45 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  30.06 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  41.07 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  25.78 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
295 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  27.12 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  34.75 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  40.98 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  25.87 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  48.84 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  31.78 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  39.29 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  31.62 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.03 
 
 
483 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.62 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2679  copper ABC transporter permease  36.84 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.81 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  33.9 
 
 
370 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
291 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  31.87 
 
 
330 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
381 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>