83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2968 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  100 
 
 
279 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
273 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  36.17 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  34.75 
 
 
299 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  33.9 
 
 
298 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  31.77 
 
 
322 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  32.56 
 
 
298 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  31.29 
 
 
265 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
319 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 
278 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  34.17 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  31.53 
 
 
269 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 
277 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 
290 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  27.21 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  27.05 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  31.2 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  26.74 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  30.85 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  26.6 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  27.43 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
623 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  27.87 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  28.02 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  26.78 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  29.36 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  28.02 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  26.03 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  25 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.33 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  27.85 
 
 
276 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 
283 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  37.61 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  23.03 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  25.28 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  27.32 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  29.66 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  27.65 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  27.08 
 
 
278 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  30.89 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  28.38 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  27.91 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  43.55 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  23.24 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  37.33 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  30.51 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  32 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.46 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  43.75 
 
 
276 aa  45.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  28.57 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  35.42 
 
 
394 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  28.57 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 
383 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  28.8 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  22.94 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.06 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  28.18 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  24.71 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  27.88 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.26 
 
 
367 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  28.35 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
272 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>