81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3872 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  100 
 
 		 394 aa  787    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  72.52 
 
 		 397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  61.32 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  61.32 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  30.47 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  30.26 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  30.51 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  30.26 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  30 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  29.74 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  29.92 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  30.18 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  30.18 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  29.92 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  33.01 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  29.92 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.41 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.06 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  31.07 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.53 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  27.45 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.75 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  24.14 
 
 		 830 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.85 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  26.51 
 
 		 775 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  30.2 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  20.37 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  28.35 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 383 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 193 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  25.37 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  28.41 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0618  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.15 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.15 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.32 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  24.02 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  27.24 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25.91 
 
 		 373 aa  46.6  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  23.88 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  23.88 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  23.88 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  23.88 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  23.88 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  26.73 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  25.57 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  35.79 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  39.33 
 
 		 278 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  23.38 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  33.75 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  23.35 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.14 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  23.35 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>