137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0769 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  100 
 
 		 775 aa  1527    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  30.17 
 
 		 830 aa  145  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  32.74 
 
 		 409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.63 
 
 		 397 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  34.74 
 
 		 408 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.89 
 
 		 398 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 394 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 394 aa  104  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  32.72 
 
 		 403 aa  95.9  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  30.63 
 
 		 308 aa  91.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  34.11 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  35.65 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 193 aa  77.4  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  32.84 
 
 		 319 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  36.96 
 
 		 321 aa  73.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  26.75 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  42.05 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  35.09 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  33.33 
 
 		 308 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  29.05 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  29.88 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  28.38 
 
 		 292 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  29.36 
 
 		 234 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  21.94 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  27.95 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  34.76 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  44.16 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  30.14 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  32.88 
 
 		 379 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  32.88 
 
 		 379 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  34.65 
 
 		 287 aa  57.4  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  27.27 
 
 		 246 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  31.29 
 
 		 321 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  27.44 
 
 		 379 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  27.44 
 
 		 379 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  42.86 
 
 		 273 aa  55.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  27.69 
 
 		 394 aa  55.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  27.93 
 
 		 280 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  32.88 
 
 		 379 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  41.49 
 
 		 241 aa  55.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  27.74 
 
 		 379 aa  55.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 		 405 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  32.43 
 
 		 379 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  32.61 
 
 		 302 aa  54.7  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  31.98 
 
 		 379 aa  54.3  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 382 aa  54.3  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  32 
 
 		 288 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29.56 
 
 		 269 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  36.59 
 
 		 420 aa  53.5  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 397 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  31.25 
 
 		 241 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  35.92 
 
 		 235 aa  53.9  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  32.43 
 
 		 379 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  25.88 
 
 		 236 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  25.88 
 
 		 236 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  25.88 
 
 		 236 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  27.27 
 
 		 394 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0292  Abortive infection protein  41.89 
 
 		 310 aa  53.5  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2082  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 270 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0361  abortive infection protein  34.62 
 
 		 317 aa  52.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  33.54 
 
 		 381 aa  52.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.87 
 
 		 267 aa  51.6  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  27.78 
 
 		 237 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  34.83 
 
 		 289 aa  51.2  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  30.68 
 
 		 238 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  31.31 
 
 		 288 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  30.68 
 
 		 237 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  26 
 
 		 244 aa  50.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2393  Abortive infection protein  31.47 
 
 		 299 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.387939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  30.68 
 
 		 237 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  29.37 
 
 		 297 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  27.81 
 
 		 237 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  32.55 
 
 		 378 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3105  Abortive infection protein  30.84 
 
 		 432 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  35.96 
 
 		 279 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  37.8 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  37.8 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 538 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  31.53 
 
 		 289 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  31.65 
 
 		 246 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  31.87 
 
 		 399 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0390  Abortive infection protein  32.11 
 
 		 321 aa  49.3  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  29.23 
 
 		 237 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  29.23 
 
 		 227 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  33.94 
 
 		 282 aa  48.5  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  28.65 
 
 		 237 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 		 228 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2041  protease, putative  27.74 
 
 		 287 aa  48.1  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00120483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  34.55 
 
 		 396 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  29.23 
 
 		 237 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  27.07 
 
 		 304 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.69 
 
 		 269 aa  48.5  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  29.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>