170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1131 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  100 
 
 
390 aa  777    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 
405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.1 
 
 
409 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 
394 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
394 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  27.2 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  21.93 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.02 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  26.82 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.08 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  23.39 
 
 
830 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  26.38 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  23.13 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  31.28 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  28.49 
 
 
775 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  25 
 
 
352 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0115  ABC transporter, permease protein, putative  24.71 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0254  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  26.64 
 
 
378 aa  56.6  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 
366 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  25.35 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  25.74 
 
 
394 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 
369 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  26.48 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  28.07 
 
 
911 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  28.07 
 
 
911 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  28.07 
 
 
911 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  29.24 
 
 
913 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  28.07 
 
 
911 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  28.07 
 
 
911 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  28.07 
 
 
911 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  28.65 
 
 
913 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.69 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  28.07 
 
 
911 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  27.49 
 
 
911 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.35 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 
369 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  27.49 
 
 
911 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.41 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  23.97 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  26.36 
 
 
394 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  27.49 
 
 
913 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.58 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  25 
 
 
927 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  24.77 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  20.97 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  25.93 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  28.07 
 
 
913 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  25.48 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  24.05 
 
 
373 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.56 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  24.38 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  23.33 
 
 
912 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  25.73 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>