64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0071 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  100 
 
 		 379 aa  763    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  92.35 
 
 		 379 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  98.42 
 
 		 379 aa  755    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  92.61 
 
 		 379 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  98.94 
 
 		 379 aa  759    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  98.42 
 
 		 379 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  94.2 
 
 		 379 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  92.35 
 
 		 379 aa  694    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  92.08 
 
 		 379 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  78.1 
 
 		 377 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  71.5 
 
 		 378 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  72.02 
 
 		 387 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  72.18 
 
 		 382 aa  568  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  75.4 
 
 		 378 aa  566  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  70.98 
 
 		 381 aa  564  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  71.5 
 
 		 378 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  34.19 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  30 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  28.09 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  30.54 
 
 		 394 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  30.27 
 
 		 394 aa  125  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  27.64 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.17 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  24.57 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.16 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.66 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.4 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  32.88 
 
 		 775 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  25.25 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  25.23 
 
 		 830 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  26.36 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  23.05 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.08 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  27.2 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.61 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  26.53 
 
 		 157 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  21.23 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.96 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  22.62 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  21.88 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  29.91 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  22.29 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.22 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  22.22 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  23.77 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>