71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3196 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  100 
 
 		 408 aa  800    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  42.96 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  42.01 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  36.17 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  27 
 
 		 775 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  40.17 
 
 		 830 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.73 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  30.59 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  24.64 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  27.34 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  26.96 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  27.34 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  30.14 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  32.31 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  30.06 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  26.73 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  26.43 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  26.43 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  26.57 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  25.36 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  27.58 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  25.36 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  25.12 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  25.36 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  26.6 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  24.76 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  27.01 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.36 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  32.03 
 
 		 273 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 378 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  30.15 
 
 		 157 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  25.09 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  33.33 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.65 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  25.65 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  33.74 
 
 		 274 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  33.74 
 
 		 274 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  19.93 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  23.88 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  26.16 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  40.3 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>